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用基因检测方式寻祖

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发表于 2018-3-18 12:48:23 |显示全部楼层
本帖最后由 whhjm 于 2018-7-13 07:33 编辑

大家好!我是湖北武汉的何菊明,以前常用的帐号上不了这个网。现改用原来给老乡注册的这个帐号(whhjm),发一份资料,供大家研究参考。

大家知道,人类Y染色体上的基因只能由父亲传递给儿子,因此在Y染色体上留下了追溯男性传承的信息。
人体细胞当中的DNA不单单能决定眼珠和皮肤的颜色,而且还留下了我们祖先的信息。一个孩子的基因当中包含着父亲和母亲双方的遗传信息,但其中只有两个部分保存着相对纯粹的父系或者母系遗传信息:Y染色体(由父亲传给儿子),线粒体DNA(由母亲传给儿女),Y染色体是男性特有的,拥有相同Y染色体的男性必定源自同一祖先。在进化中,Y染色体上发生的突变会保留下来,而且会传递到男性后代。这些信息是该家族的一个宗族标记,找到这些遗传标记,不仅可以得到自己父系或母系的相关资料,而且还可以知道与哪些人在什么年代共祖。
我们检测DNA很简单,只需要用棉签从口腔壁上刮下一些唾液作为细胞样本,然后寄给检测机构,由他们用专业仪器进行分析,就可检测出基因中的一些独特遗传标记,然后告诉你所属基因类型和相关信息。
男性Y基因类型也称单倍群,按英文字母起头编号,A~T共16大类(详见4#微基因数据表)。
目前各基因公司,均以字母数字组合表示Y基因类型(也称单倍群),通过对照表,我们可以查出全称。

1#附件:
(1)Y基因树图示。表示各大类之间的关系,其中最后一列(新命名)才是我说的全称。图中只是顶层Y基因类型。
(2)23魔方公司数据(何姓,检测81人)。第一列是基因类型编号;第二列是全称,可反映各基因类型之间的关系;第三列是各类型的参检人数。


对于我们外行,不用关注第一列的那些符号,要了解各类型基因间的关系,主要看全称或Y基因树。

以何姓人的Y单倍群为例(见附件2),第二列是各单倍群的全称,前面表示上游,字母数字越多则中下游信息越具体。前面相同(顺序必须相同),则起源一致。反之,前面字母数字相同的越少,说明共祖年代越早。前一两个字母数字不同的,共祖时间都是万年级别的,比如O1与O2,Q与O大类。古DNA一般测出的都较短。
如果两人通过高通或全序检测,全称很多位都相同,才有可能在三五千年内共祖。
81位何姓人参加了23魔方基因公司的Y基因检测,有49种不同的基因类型。那些全称字母数字很长的,是因为同类型中有人测了高通或全序。
如果再深入检测,这49种基因类型又将产生更多的下游分支。要判断两千年内共祖,有的需要测到十多位,这只有采用全基因检测(全序)或高通量检测(高通)。

检测结果表明,所有姓氏的Y基因都很杂,包括号称是孔子后人的基因。
从统计数据看,约78%的人同属于O大类基因。商周王族、韩王的Y基因类型,都没有检测过,目前的所有说法都不是定论。但是,可以肯定:即使族谱记载是韩王后裔,大部分人的Y基因都不会与韩王相同!这点要大大超出我们原来的预期。
按姓氏寻找王族,可信度不高,他们的基因早就分散到各姓氏人口中去了。姓的出现可能跟原始部落有关,最早的姓不足三十个,都是女字偏旁。早期还存在大量与古帝或古老氏族有关的氏姓,受三代王族特别是周朝影响,慢慢简化、改姓,保留至今的很少。姓氏合一是秦汉时期的事,人口占多数的平民,成姓时间一般都在秦汉至魏晋时期,边远地区成姓更晚,平民随姓比较普遍。还有一种说法:灭国后,国人以国为姓。这个说法没什么依据,灭国后以国为姓的主要是王族或有关上层人物。即使平民也以国为姓,那更会出现同一姓氏基因类型不同。

国内23魔方基因公司,公布了全国前75个姓氏人口的Y-DNA结果,前五大姓检测人数比较多,只给出了主要的基因类型及比例,第6~75姓氏给出了全部类型与人数(共5856人),按人口排名前七十五个姓氏,一共检测了八千多人。

下面是23魔方公司的统计数据。在第6~75姓氏中,人数较多的类型的人数、比例如下:
O1a大类共848人;O1b大类共577人。
O2a1大类共1071人;
O2a2a大类共332人,O2a2b大类共1688人。(O2a2共2020人)
O2b大类共75人。
O1占比24.3%,O2占比54.1%,这跟前五十姓氏统计的结果差不多。
O1大类中的F492及F656,合计405人,占被测总人数的比例6.9%;
C类型共有550人,占被测总人数的比例9.4%;
N类型共362人,占比6.2%;
Q类型共有149人,占被测总人数的比例2.5%;
D类型共101人,占比1.7%。
(以上比例仅根据23魔方公司部分数据计算,但与微基因数据计算的比例接近)

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发表于 2018-3-18 13:20:29 |显示全部楼层
本帖最后由 whhjm 于 2018-6-14 10:48 编辑

附一:各姓氏基因类型
下面附上杨郭何韩人口的Y基因类型(单倍群),以及第6~75姓氏人口的Y基因类型统计表。
同姓不同源的程度,远超我们原来的预计。下面是几个姓氏人口的Y基因检测结果示例,以及前75个姓氏的统计结果。
按照有关专业人士的说法,表中不同大类的共祖时间更早到万年以前,即使属于同一基因类型,不测全序也很难确定两千年内共祖。那样,同一姓氏人口共祖于周朝某位人物的,所占的比例将会很小。
大部分人都明白,族谱攀附名人、王族是普遍现象。即使是距今三至五百年前共祖的谱上支系,也有很多错接。如果晚近支系基因类型相同,那正确率就比较高了。

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发表于 2018-3-18 13:51:06 |显示全部楼层
本帖最后由 whhjm 于 2018-11-17 17:57 编辑

我在2016年夏参加了另一家公司(微基因)的检测,Y基因是Q-M120下的F1626。全称是Q1a1a1,这是男性Y染色体基因标记,M120是分类编号。M120几乎只分布在中国,比例接近3%,分布比较均匀。Q单倍群在全球范围内,主要分布在北亚、东亚和美洲。

Y基因类型也称Y单倍群。从目前的检测看,中国北方及中部古人的DNA存在较多的N、Q、O、C、R类型,今天汉人普遍存在的O类单倍群,在三千年前的北方并不占优势。山东曲阜孔子后裔,检测的单倍群主要是C2c与Q1a1类型,而孔子是商朝贵族后裔,传统历史认为商、周王室的血缘相同。

考古与史籍均证实,山西曲沃县、绛县、翼城县,是周朝晋国早中期地盘。在山西曲沃县,考古挖掘了九代晋侯墓。还有南边的羊舌村晋国大墓,以及翼城、绛县大墓。
近几十年来,在原晋国地盘上发掘了成千上万座古墓,只检测了绛县横北大墓的基因。已检测27名男性墓中人骨的Y-DNA,有Q、O、N三种Y基因类型。平民多是Q1a1,大部分贵族也是此类型(包括葬八鼎的)。

绛县横北墓地的发掘,自2004年开始至2007年12月结束。发掘西周时期墓葬1200余座,资料多未发表。这里被专家们称作倗伯家族墓,它属于晋国吗?目前他们认为不是。我经过一年多的深入研究,发现他们的证据很弱,自相矛盾、与史籍不符之处颇多。横北墓位于横水北面,水之北为阳,横北即横阳。秦末汉初的韩王韩成号“横阳君”,很可能与此地有关。史书也能反映,绛县是“曲沃代翼”前后,晋国小宗的大本营。韩王直系祖先是桓叔次子韩万,桓叔、庄伯、武公这三代人在晋国以小宗取代大宗,已被古书《竹书纪年》证实。即,叔叔抢了侄子的国君之位!
现在只知道春秋中晚期的晋国都城,在山西侯马市(古名新田)。晋国大宗都城称翼,小宗都城多以绛命名,史书中的故绛在今绛县、闻喜县,新田的西面是新绛县。
山西闻喜县由故绛分出,原名桐乡。其东北角与绛县西南面相邻,这里有全国闻名的宰相村,宗祠仍称晋祠。1970年横北镇从闻喜县划给绛县,绛山西南角今天仍然属于闻喜县。著名历史地理学家谭其骧先生认为,曲沃桓叔所封之地在绛山以南。

附二:山西晋国古墓位置图
图中东西方向的一条山脉就是绛山,绛县县城北面的山形是否很像中国梧桐树的叶子?叶尖左下方是古绛镇。史书记载了周成王“剪桐封弟”,唐叔虞的初封地,会不会与这个地形有关?
附三:古代北方人口Y基因
(第一列是考古发现地点,第一行N、O、Q等是基因类型)

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发表于 2018-3-18 14:00:50 |显示全部楼层
本帖最后由 whhjm 于 2018-5-23 14:32 编辑

根据吴微微等2011年论文提供的4451例浙江汉族17Y-STR数据,出现频率在前10位的17Y-STR单倍型。因为存在并列关系,所以一共是13个。

排序  编号  匹配样本数  Y-SNP单倍群
1      H1        26         O1a1a2-CTS52
2      H2        19         O1a1a1a1-F492
3      H3        18         O1a1a1a1-F492
4      H4        17         Q-M242
5      H5        16         O1a1a1a1-F492
6      H6        13         Q-M242
7      H7        12         O1a1a1a1-F492
7      H8        12         O1a1a1a1-F492
9      H9        11         O1a1a1a1-F492
10    H10      10         O1a1a1a1-F492
10    H11      10         O1a1a1a1-F492
10    H12      10         C2c-F1067
10    H13      10         O2a1c-IMS-JST002611

其中的Q-M242,是M120的上游。限于技术与经费,他们没有继续往下游检测。按专业人士的说法,Q-M120产生时间早于五千年。从现有数据看,国内Q基因百分之九十以上都是M120或其下游(见下表左下角)。

Y基因检测的费用:
现在,基因检测初级(如17Y-STR数据)不到一百元,可初步排除几千年内共祖,或判断有无可能同祖。比如,族谱中不同支系的人物,如果基因不是同一类型,那就肯定不同祖,由此可解决族谱错接问题。
要测出各单倍群的更多下游,得有部分人测全序或高通。我的检测属于中级,当时报价1000元,享用优惠后700元。如果测高通(信息量比全序低),最低报价是1500元。测全序当然会更贵,但可计算两三千年内共祖。

附四:微基因公司数据
(所有姓氏,共18,832人)

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发表于 2018-3-18 14:30:36 |显示全部楼层
菊明教授!文章看不懂。详细说说怎样读懂有关内容。谢谢!
我是何氏中的一员,也是中华民族现存的一个细胞,我活着是为大家更好地活着!
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发表于 2018-3-18 14:37:34 |显示全部楼层
本帖最后由 whhjm 于 2018-6-14 10:59 编辑

我们都是炎黄子孙这一说法,已被基因研究否定。其实,这个说法很晚(清末),也不符合逻辑(那个时代就两个男人?上句的“否定”,是否定“我们都是”,并未否定先秦时有一部分人认炎、黄为祖)。史书中说夏商周王族同出一脉,是否属实?唯有通过检测这些王族遗骨的Y基因来回答。目前的考古发掘,还没有发现夏朝大墓,河南安阳(商)与陕西周原(周)的大墓也未报告有人骨。能够证实姬周王室Y基因的只有山西晋侯墓人骨,辅证黄帝世系的有河南淅川春秋时期楚国贵族墓、湖北随州曾侯墓的人骨,辅证韩王基因的有湖北襄阳韩冢中的东晋韩法立家人遗骨。
对于商、周王族Y基因,目前争议较大的有O1-F492、C-F1319、Q-F1626。
在以上统计数据中:
O1大类中的F492及F656,合计405人,占被测总人数的比例约6.9%;
C类型中的C-F1319共137人,占被测总人数的比例约2.3%。
Q类型共有149人,其中M120共10人,F1626共125人。M120及F1626占被测总人数的比例约2.3%;(考虑到张、刘两大姓的比例比较高,在总人口中的比例应在2.5%)

人口排序前50姓氏中,F1626、F492比例与姓氏对应如下:
F1626                F492
(含部分M120)    (含全部F656)
韩8.5%             叶24.4%
胡7.8%             沈14.9%
郭5.4%             谢13.1%
丁5.3%             余12.5%
赵5.0%             何12.3%
宋4.7%             胡12.1%
潘4.7%             袁11.9%
魏4.5%             许11.5%
冯4.2%             郑11.1%
梁4.1%             潘10.9%
杨4.0%             周9.2%
张3.9%             徐9.1%
程3.9%             蒋8.8%
曹3.8%             罗8.6%
刘3.6%             朱8.1%
高3.2%             程7.8%
吕3.2%             陈7.7%
孙3.1%             彭7.5%
任2.9%             魏7.5%
许2.6%             董7.0%
周2.3%             杨6.8%
郑2.2%             邓6.7%
朱2.2%             杜6.4%
李2.0%             林5.4%
(F492在前二十多姓氏中的比例大,说明这个基因类型在各姓氏中分布的均匀度较低。单倍群O1,多属南方人口)
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发表于 2018-3-19 06:58:04 |显示全部楼层
中国人的祖先DNA-Y检测已经证实
http://www.360doc.com/content/15/0224/20/276037_450542745.shtml
我是何氏中的一员,也是中华民族现存的一个细胞,我活着是为大家更好地活着!
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发表于 2018-3-19 07:28:35 |显示全部楼层
英语就是邯郸方言。意大利语就是中国方言。天下是一家?!

重构中华文明
http://www.360doc.com/content/15/0321/12/22201879_456901271.shtml
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